El juez de los ERE, además de procesar a los expresidentes Chaves y Griñán, seis exconsejeros y una veintena de exaltos cargos de la Junta, ha exculpado a 24 personas, entre los que destacan tres exconsejeros: uno de Empleo (Manuel Recio) y dos de Innovación (Martín Soler y Antonio Ávila). Todos ellos llevan siendo investigados desde hace años y fueron llamados a declarar, algunos en varios tribunales al haber sido aforados según qué caso. Cabe recordar que el sobreseimiento provisional del proceso se corresponde exclusivamente con esta parte de la causa, la denominada del 'procedimiento específico'.
También destaca el archivo para el expresidente de El Monte José María Bueno Lidón y el presidente de Unicaja Banco, Braulio Medel. Exviceconsejeros, secretarios generales, directores generales y un largo etcétera de excargos y jefes de servicio han sido exculpados, principalmente aquellos pertenecientes al consejo rector de IDEA, a quienes Alaya imputó en mayo de 2014. La lista completa de exculpados es la siguiente:
Consejeros: Manuel Recio, Martín Soler y Antonio Ávila.
Exviceconsejeros: José Haro Bailón, Juan Carlos Soriano, Juan Paniagua.
Secretarios generales: Francisco García Martínez, Ana María Peña, Ángel Garijo, Isabel de Haro, Pilar Rodríguez, José Domínguez Abascal.
Directores generales: Buenaventura Aguilera Díaz, Manuel López Casero, Jesús Nieto
Interventor de la Consejería de Empleo: Juan Luque Alfonso.
Director general de IFA: Antonio Lara.
Directores de administración y finanzas de IDEA: Pablo Millán y Juan Vela Quiroga.
Jefe de servicio de la Dirección General de Trabajo y Seguridad Social: Antonio Diz-Lois Ruiz.
Expresidente de El Monte: José María Bueno Lidón
Presidente de Unicaja: Braulio Medel
Presidente de la Corporación Tecnologica de Andalucia: Joaquín Moya-Angeler
Presidente de la Red de Espacios Tecnologicos de Andalucía: Felipe Romera.