Las mutaciones de ómicron ya existían en pacientes infectados meses antes de ser dominantes, según un estudio que ha usado una técnica de secuenciación ultra profunda que permite detectar secuencias víricas no detectables por los métodos habituales.
Así lo han constatado investigadores del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) y de la Fundación Jiménez Díaz. Los resultados se publican en la revista “Journal of Clinical Investigation”. El trabajo ha analizado en detalle muestras de hisopos nasofaríngeos correspondientes a pacientes vacunados y posteriormente infectados durante la tercera ola de la pandemia en España.
Este estudio ha podido desarrollarse gracias al trabajo previo de puesta a punto de una potente metodología de secuenciación ultra profunda que permite detectar secuencias víricas mutadas que se hallan en proporciones muy bajas, que no son detectables por las técnicas de secuenciación habituales de poca profundidad.
“De cada muestra analizada y de cada trozo del virus analizado obtenemos muchas miles de secuencias, lo que nos permite detectar mutaciones a distintos niveles de frecuencia coexistiendo dentro del paciente infectado”, detalla Celia Perales, investigadora del Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC) y del Instituto de Investigación Sanitaria de la Fundación Jiménez Díaz.
Los resultados han desvelado que a pesar de que los pacientes se infectaron con la variante alfa, predominante en esa fecha (entre enero y marzo de 2021), cambios correspondientes a las variantes delta plus, iota y ómicron ya estaban presentes en esas muestras meses antes de que adquiriesen relevancia epidemiológica.
“Este trabajo resalta la necesidad de analizar las poblaciones de virus con alta resolución y en profundidad para obtener una visión conjunta de los muchos mutantes que coexisten en cada individuo infectado”, apunta por su parte Esteban Domingo, investigador del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CBMSO-CSIC-UAM).
Los análisis podrían permitir el seguimiento de mutaciones o conjunto de mutaciones potencialmente relevantes con anterioridad a que puedan formar parte de variantes peligrosas, aclara un comunicado del CSIC. Dos de los autores de este trabajo, Celia Perales y Esteban Domingo, pertenecen al Centro de Investigación Biomédica en Red de enfermedades hepáticas y digestivas, del Instituto de Salud Carlos III. Gracias a ello, los conceptos sobre variabilidad del virus de la hepatitis C que durante años han estado desarrollando pueden ser ahora aplicados al virus causante de la covid-19, según el CSIC.