Francisco Javier Escobar Borrego desarrolla su labor profesional como profesor titular de Literatura Española en la Universidad de Sevilla. Desde este prisma académico, ha dedicado trabajos de investigación al pensamiento estético y obra de clásicos áureos, prestando especial atención tanto al Humanismo, vernáculo y neolatino, como a la pervivencia de la tradición clásica en el Siglo de Oro. Respecto a la investigación en Literatura Española Contemporánea, ha centrado su interés en el Modernismo y la Literatura de la segunda mitad del siglo XX, con preferencia por el imaginario estético de Valente.
Por su investigación y docencia especializada en flamenco y otras músicas de tradición oral, ha sido editor de varios volúmenes monográficos dedicados al flamenco, entre ellos Imaginario del flamenco: representación literaria, poética musical e historia cultural, en Cultura, Lenguaje y Representación (2020), con Emilio J. Gallardo. Codirector de Enclaves. Revista de Literatura, Música y Artes Escénicas (US) y de la colección Flamenco de la Editorial de la Universidad de Sevilla (EUS), ha publicado también obras discográficas como A contratiempo (2009), Palimpsesto. Morente in memoriam (2012), Eurídice XXI (2014) y Miniaturas espirituales para niños (Suite en dos movimientos), en Anjara. Musica del mondo per Jangany (2016).
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